南港

南港位于海口市秀英区滨海大道顶端，毗邻新海港区，主要服务对象为粤海铁路，进出海南岛的火车，必须从此港搭载轮渡客滚船，横渡琼州海峡后，才能实现与全国铁路网互联互通。

二、文昌市

3、清澜港

清澜港

清澜港位于海南省文昌市，是国家一类开放口岸，海南“四方五港”重要港口之一，是一个集商、渔、军、公务为一体的综合性港口，占地面积1.424平方公里，已建了5个5000吨级码头，开通了8条航线。此外，清澜港也是海南三沙市后勤补给的重要港口基地，还是海上丝绸之路的重要节点，更是文昌航天发射中心的重要运输口岸，目前主要经营矿产、天然气、海产品、航天发射、文昌鸡以及椰子产品进出口等业务。

4、铺前港

铺前港

铺前港位于海南省文昌市铺前镇，是一个天然良港，是海南岛历史悠久的港口之一，渔业发达，盛产的马鲛鱼、黑鲷、红友、石斑颇有名气。此外，铺前港地理位置优越，紧靠省会海口，海文大桥的开通更是拉近了铺前与海口的距离。

三、琼海市

5、潭门港

潭门港

潭门港位于海南省琼海市潭门镇，渔业捕捞和渔业养殖业发达，港口可停泊1000艘渔船以上，是海南东部沿海最大的中心渔港，是经国家农业农村部认定的一级渔港，也是中国前往南沙作业渔船最重要的补给母港。

6、龙湾港