1938年1月，国民政府军事委员会在武汉召开全国师以上各级参谋长会议，旨在总结抗战的经验教训，日后给予敌人更强力的打击。八路军也应邀派出了4名代表，分别为总部参谋长叶剑英、参谋处长彭雪枫、高级参谋边章五以及第115师参谋长周昆。
这次会议本该是周昆在我军中地位更进一步的标志，不料他的内心却因此出现了一丝波澜。
为期三天的会议结束后，1938年2月初，周昆照计划从武汉乘坐火车返回山西，在途经临汾时与彭德怀、左权汇合。他本该向领导汇报军事会议的相关情况，不料在这个过程中，周、彭二人闹了一些不愉快。
根据当时在场的作战参谋王政柱回忆：他（周昆）在向参谋长汇报会议情况时流露出了不满情绪。他说自己在武汉如何“丢脸”，“像叫花子一样”，羡慕国民党将领有小公馆、小汽车和小老婆。周昆发牢*说没有这些也就算了，组织甚至连雇黄包车的零钱都给得很“小气”。
毫无疑问，彭副总立马对周昆的危险思想进行了严厉批评，《彭德怀全传》中对此有所提及：彭德怀怒批周昆忘掉了“做共产党人的光荣”，忘掉了共产党与国民党的区别。
犯了错误不可怕，可怕的是犯错之后还不知悔改。从资料的描述来看，当时周昆对领导的批评十分不服气，当场还嘴顶撞，气得彭德怀直拍桌子。不仅如此，在返程时，周昆依旧带着情绪，显然没有被说服。
而返程的周昆身负另一项重要的任务：他从位于临汾的国民党二战区司令部领走了6万法币的现钱，是为第115师这个月的军饷。会后，他将一个挎包交给警卫员，嘱咐其中有重要文件，要他务必要交给115师作战科科长王秉璋。当挎包送到后，王科长打开一看，只见其中有3万法币和一封信，周昆在其中写道：“共领取6万块，我带走了3万，另3万交警卫员带回，望查收。”
这便是这位工农革命军元老在历史上留下的最后一句话，随后便神秘地消失了。
事后许多年里，组织一直在寻找周昆的下落，有说法称他隐姓埋名回到了老家生活，鉴于没有从事任何反革命活动，组织便也不再追究。然而经查证，这种说法并不确凿。
此外，学界多数人认为，结合周昆消失前的表现，他很有可能是卷款跑路了。正所谓“由俭入奢易，由奢入俭难”，见识过国民党将领奢华生活的周昆遭到了动摇，因此做出了冲动之举。要知道，3万法币在当时可不是一笔小钱，足够一名普通人逍遥快活一辈子了。
首先，从逻辑来考虑，既然周昆想要享受奢靡的生活，都打算逃跑了，为什么不把6万块一并卷走？
其次，退一步讲，就算他良心未泯，经过痛苦的挣扎后只拿走一半钱款，但从资料来看，当时法币在中国并不是流通货币，而一个人要拿着几万外币去兑现，很难不引起注意。然而倘若周昆一直藏着钱不用，那么他昧下这笔钱又有什么意义呢？
再者，正如115师作战科长王秉璋所说，周昆似乎并没有这样做的动机。
要知道，周昆是参加过早期革命的老干部之一，在反动派的数次围剿中都没有动摇，为何偏偏却在革命转危为安、队伍不断发展壮大、形式一片大好之际突然走了歪路？况且周昆接受过高等教育，通情达理，很难想象他会做出这样糊涂的选择。
也有人说，或许周昆只是嘴上发发牢*；他之所以独自携带一半军饷，是避免“鸡蛋打碎在同一个篮子里”，害怕一出事全给弄丢了，这也能凸显他做事的缜密。然而在返回途中，周昆所携带的巨款被歹人盯上，他也因此遭遇不测，落了个“活不见人死不见尸”的下场。
这种情况乍听有些突兀，但在那样混乱的年代里，这并非没有可能。
