名侦探柯南：工藤新一。

高中生侦探工藤新一虽然只有17岁，但凭借着来自著名侦探小说家的父亲的优良遗传基因，以高超的推理能力破获了不少令警察们束手无策的悬案，成为了名噪一时的名侦探。然而命运之神却跟他开了个大玩笑。

在一次与他的青梅竹马毛利兰到游乐场约会的时候，新一无意间看到两个黑衣人进行非法交易，因为看的太入神被另一个黑衣人从后面击昏，黑衣人趁机给他喂下犯罪组织新研制出来的毒药。结果新一虽然幸运的没有死，可是当他醒过来的时候居然变成了5岁小孩的模样。

如果让黑社会组织知道新一还活着，就又会招来*身之祸也会连累到身边的人，所以新一只把事情告诉了邻居阿笠博士。这时小兰来博士家找新一，在她的追问下新一急中生智脱口而出，谎称自己是阿笠博士的远房亲戚"江户川柯南"。

柯南这两个字取自新一最崇拜的大侦探"福尔摩斯"之父--柯南道尔，而江户川则源自日本著名的侦探小说家江户川乱步，在博士的帮助下成功的瞒过了小兰。

为了搜集黑暗组织的情报，新一寄宿到小兰家-毛利侦探事务所。谁知小兰的父亲毛利小五郎只是个三流的糊涂侦探，所以遇到棘手的案件柯南就自己来侦破，再利用阿笠博士的发明让人以为是毛利小五郎的功绩，从而开始了一个"史上最年轻的名侦探"的精彩探案历程。