在《名侦探柯南》中，修学旅行之后工藤新一被发现是在第129集《黑暗的目标》中。在这一集中，工藤新一被组织成员毛利小五郎的学生，参加了一个推理游戏。然而，在游戏过程中，他被迫饮下了组织研发的药物APTX4869，使他变成了小孩。从此以后，工藤新一化名江户川柯南，开始了他的侦探生涯。这一集标志着工藤新一从此失去了原本的身份，成为了柯南。

998集，柯南刚从修学旅行中回来。

小兰亲了新一，帝都高中举行了修学旅行，小哀在给柯南解药时候提出的条件也是让人老脸一红而小兰全程被称作工藤太太，在柯南《红色修学旅行·恋红篇下》新年特辑４集连放。