申请流程分为以下几步：【选择城市、机动车和通行码类型】->【通行时段需求】->【选择通行线路（区域）】->【上传通行码材料】->【提交申请】。

第一步：选择城市、机动车和通行码类型。选择通行码申领城市（默认用户注册地）后，继续在已备案的机动车列表中选择申领通行码的机动车，批量申请最多可选择10辆车，选择通行码类型后，根据实际通行需求选择时段“临时、短期或中长期”。点击“下一步”进入第二步。

注意事项：机动车存在逾期未检验、注销、被盗抢、扣留、达到报废标准、事故逃逸等情形的，不允许申请城市货车电子通行码。

第二步：录入通行时段需求。用户根据实际通行情况，录入通行时段需求。点击“下一步”进入第三步。

第三步：选择通行线路（区域）。用户可通过三种方式选择通行线路（区域）。方式一：自行规划线路。申请方式选择“线路规划”，通过设置起点、途经点、终点后系统根据地图算法规划路线，用户选择其中一条线路作为通行线路。方式二：选择区域通行。申请方式选择“区域通行”，用户直接在通行区域列表中选择一个区域作为通行区域。方式三：录入通行道路。申请方式选择“通行道路录入”，用户通过手工录入需要通行的每条道路名称。点击“下一步”进入第四步。 （目前，系统支持方式一：自行规划线路；方式三：录入通行道路）