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由于，哥萨克英勇善战，所以当时统治乌克兰的波兰立陶宛联邦便想方设法将他们收编，在经过多方尝试后，最终形成了“注册哥萨克”制度的诞生。

1582年波兰立陶宛联邦

波兰立陶宛联邦通过给予部分哥萨克特殊地位，并提供薪酬，将他们收编，这些注册的哥萨克便成为了波兰立陶宛联邦的武力。在注册哥萨克初创之时，其名额才300人，以后经过争取，注册哥萨克名额才逐步放宽到6000人。注册哥萨克也成为了波兰立陶宛联邦用以对抗奥斯曼土耳其人与俄国人的重要武装力量。

1648年的波兰立陶宛联邦

在与土耳其人的战争中，哥萨克威名远播，使得波兰立陶宛联邦意识到不受约束的哥萨克，虽然可用之抵御土耳其入侵，但也可能是破坏国家秩序的双刃剑。因此，注册哥萨克的创建，本来就是波兰人用以约束整个哥萨克社群的工具，然而事实证明，这种努力的成效不大。

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哥萨克很多时是波立联邦、俄罗斯的雇佣兵，曾经参与过大大小小的战役，是联邦东方防线的一支中流砥柱。哥萨克始终是波兰立陶宛联邦的心头大患。