花朵不同，双子叶植物有4～5枚花萼，单子叶植物的花萼是3的倍数；根系不同，双子叶植物为直立根系，单子叶植物为须根系；茎秆不同，双子叶植物的茎秆会逐年加粗，单子叶植物茎秆不变；叶片不同，双子叶植物是网状脉，单子叶植物是平行脉。

双子叶植物有4～5枚花瓣和花萼，若花瓣结合排列，则会产生4～5个裂片，并且花粉中有3个萌发孔，单子叶植物花瓣花萼的数量为三枚或是3的倍数，花粉上只有一个萌发孔。

双子叶植物的根系多为植物根系，有着一根粗壮发达的主根，周围有纤细、密集的侧根，单子叶植物的根系多为须根，主根生长一段时间后就会死亡，茎部形成不定根后就会萌发出侧根，从而构成须状根。

一般双子叶植物有两个或多个子叶，并且叶面的叶脉大多是网状的不规则图案。单子叶植物多为草本植物，一般只有1枚叶片，叶片较为平滑，可能会夹杂其他颜色。

双子叶植物在生长过程中，形成的细胞会不断的分化，向外形成韧皮部，向内产生木质部，从而不断的加粗。单子叶植物的茎秆结构较为单一，在生长过程中无法通过细胞分裂加粗，但始终保持得相同的粗细。