后来以英、法、俄为首的欧洲列强看日本这么好欺负，也纷纷与其签订了不平等的通商条约。然后派遣欧洲居民到小笠原生活，从此小笠原成为了一个多元化的种族的定居点，海岛规则由岛民自治，当时岛上的日本人地位卑微，基本是欧美人的仆人，也没有任何话语权。

到了1868年，明治天皇推翻了封建幕府制度，开始学习西方的资本主义思想。在富国强兵、文明开化的口号下，以高征地税等手段进行大规模原始积累，后来才有了和欧美同等谈判的权利。

后来的明治政府在西方列强的同意下，于1876年吞并了小笠原群岛。而定居在小笠原上的欧美居民都被划为日本公民，但是被归化的“欧美人”实际上是变成了二等公民，他们被禁止与日本女性交往，也不享受日本政府的福利政策，这迫使大部分外国人都离开了小笠原，而离开后的外籍人士将被禁止返回 。

日本人还在岛上成立了一家名为“那里”的国有农垦公司，从岛外转移了近万名劳工到小笠原从事农业生产，因为小笠原属于亚热带气候，具有冬暖夏热的特点，比较适合种植反季节蔬菜还有蔗糖，那里农垦公司就强迫岛上工人种植他们制定的产品，而所有利得都被用作了日本的军费开支。

1932年，日本把小笠原作为守卫本土的第一重要屏障，在小笠原最南端的硫磺岛上修建了（千鸟机场）还在密林里安装了155毫米的岸炮。到了二战开始后，日本在硫磺岛又设立了两座机场，904门火炮，还有20多辆坦克和23000名士兵。以当时情况来看，想要在太平洋上攻下这样一座守卫森严的岛屿，确实不简单。

1944年7月，美军拿下塞班岛后，准备进一步打击日本本土，但是塞班岛距离日本还有2300多公里，当时B29轰炸机的最大的作战半径只有2800公里，往返日本显得有些捉襟见肘，并且无法覆盖日本北部区域，所以拿下硫磺岛势在必行。

1945年2月，美国出动了38艘航母编队，2000架飞机，还10万装备精良的士兵，来攻打面积不足50平方公里的硫磺岛，在登陆前，美军消耗了24000余吨弹药把小岛几乎夷为平地，但是日本人全部躲在洞里不出来，本来计划五天拿下硫磺岛，结果整整打了一个多月，美国陆海军将士负伤19000人，阵亡近7000人，小日本才面带着微笑，从洞里爬了出来，当时的美军出于人道主义所以没有继续消灭日本的战俘。