菩提子 :在佛教经典和历史传承上，对于佛珠材质多有规定，当今的佛珠市场，涌现出大量金线菩提等以菩提为名目的籽类，但在佛教上实无地位。在佛教经典和历史传承上，菩提子的种类并不多，主要包括凤眼菩提、莲花菩提、金刚菩提、星月菩提、天台菩提。

沉香 :可以说，沉香是这几年最为风光、备受推崇的佛珠材质。然而，今天的沉香佛珠市场，假货充斥，黑灰色的“加油沉香”横行市场，其数量庞大，大约占到市场供应量的90%以上，市场上一般称为“药沉”或“ 水沉”。它让大量的消费者上当受骗，甚至大量批发商也被它蒙在鼓里，大大小小的众多零售商，乃至一些非常著名店家，同样也是受害者。

蜜蜡琥珀 :蜜蜡琥珀市场极为混乱，各种伪造的彩蜡和合成琥珀充实市场，令买家提心吊胆。有专家对于目前市场上的波罗地海琥珀的真伪，提出了强烈的质疑，称波罗地海琥珀是辗转台湾来到大陆，而台湾厂家对原材料进行了加工；另称抚顺琥珀也开始学习台湾的“先进”工艺，令人担忧。