而狐狸携带的染色体数量就和狗不同了。因物种而异，灰狐有66条（33对）染色体，耳廓狐有64条（32对）染色体，孟加拉狐有60条染色体。一些最具魅力和最知名的狐狸品种的染色体甚至更少，例如红狐，它们只有34条。随着染色体数量差距的扩大，杂交成功的几率大大降低。染色体和遗传物质数量不相容，这使得它们无法与狗一起繁殖，因为它们在种属、DNA和遗传学上缺乏兼容性。

由于狗的染色体为39对，狐狸的染色体为36对（以与狗的亲缘关系最密切的大耳狐为例）。在结合时，它们各自拿出一半分给后代，也就是75条染色体，但是这个数字是无法成对的，也就意味着他们的后代无法正常进行减数分裂。因此，即使好不容易让狗与狐狸结合成功产下后代，它们的后代也生不出下一代。

狐狸和狼分化后就出现了生殖隔离，为什么狼驯化成狗以后，它们之间依然能够继续杂交呢？

虽然狼和狗无论是外形还是生活习性都有着较大差距，但是外观和食性的差异化，并不是区分物种的主要因素，能够决定物种的其实是基因。目前来说，狼和狗的种群虽然出现了分化，但是染色体数目依然相同。

其实，最关键的因素在于时间。相较于狼和狐狸长达一千万年的分化时间来说，狼被驯化成狗只过去了短短3万年时间。3万年还不足以形成新物种，因为根据科学家们对过去物种的演化速率看，新物种的形成至少需要百万年级别才有可能。

另外，人类也在通过狼狗杂技加强这两个物种的联系。现今世界上就存在两种比较常见的狼狗：Saarloos狼狗和捷克斯洛伐克狼狗，前者是由德国牧羊犬与动物园里圈养的狼产生的后代，后者则是由人类在实验室中，将德国牧羊犬与狄莫拜狼杂交产生的。