2002年的上半年，梅西凭升入U15队，但是鉴于当时森严的等级制度，梅西无法得到出场机会。而巨星总是会闪光的。最终梅西赢得了信任，在各项赛事出场14次，打入21个进球。梅西也成为了巴萨教练们眼中特殊的一员。

梅西的名字在巴萨教练们中传开，他的速度、盘带以及进球让大家疯狂。在青训队，他出场20次打入37个进球。随后在2003年的8月份开始成为巴萨青年队的一员，2003年年底，他为巴萨C队出场。2003年11月16日，巴萨在热身赛中对阵波尔图，比赛第75分钟，仅16岁又145天的梅西替补费尔南多-纳瓦罗上场，身披克鲁伊夫留下的14号球衣，完成了代表巴萨一队的处子秀。

在2004-2005赛季前的三场季前赛中，梅西得到了出场的机会。而更令他惊喜的是，2004年的10月16日，西甲第7轮，巴萨客场对阵西班牙人，17岁3个月零22天的梅西在第82分钟替换上场，迎来了自己西甲首秀，他也是当时代表巴萨出战正式比赛的最年轻球员。随后，他分别在国王杯以及欧冠联赛中迎来出场的机会。

2005年5月1日，对阿尔巴赛特时，梅西接到小罗的挑传，一记轻巧的挑射破门。庆祝时小罗将梅西背起的画面，成为了永恒的瞬间。2005年的6月份，梅西代表阿根廷参加U20比赛，赢得最终的冠军，还获得金靴与最佳球员。2005年的9月份，梅西正式成为巴萨一线队的一员，并且延长了与巴萨的合同。而在那一年，梅西还获得了西班牙国籍，但是在最终的国家队选择中，他选择了祖国阿根廷。