在那一年的八月份，梅西成为了巴萨队长，同时34场西甲47个进球也使得他第五次捧得欧洲金靴。2018年，梅西还赢得了西甲、国王杯以及西班牙超级杯的冠军。但是在欧冠耻辱般遭到罗马的淘汰，刺痛了梅西。

梅西再一次获得了欧洲金靴，而且在这一年的梅西赢得了第六座金球。但是在集体层面，他仅获得了西甲冠军。在欧冠中连续第二年惨遭逆转，在主场3-0赢球的情况下在安菲尔德被利物浦4-0屠*。

2020年的巴萨遭遇了一系列的丑闻，作为巴萨的队长，梅西硬怼高层。而在欧冠2-8输球后，梅西掀起离队风波，最终由于不愿意与巴萨对簿公堂，最终选择留队。但是梅西与巴萨主席巴托梅乌之间的关系已经无法修复，而在梅西的脸上，也没有了昔日的笑容。