1复旦大学：1985年，上海第一医学院改名为上海医科大学；2000年4月，复旦大学与上海医科大学合并，组建新的复旦大学。

2上海交通大学：1999年9月上海农学院并入上海交通大学成立上海交通大学农学院；2001年，上海海洋水下工程科学研究院并入学校；2005年7月，上海第二医科大学与上海交通大学合并，成立上海交通大学医学院。

3同济大学：1996年，上海城市建设学院和上海建筑材料工业学院并入同济大学；2000年4月，学校与上海铁道大学合并，组建成新的同济大学，并复办医学院；2003年，上海航空工业学校划归同济大学管理。

4华东师范大学：1980年7月，上海师范大学恢复华东师范大学校名；1997年8月，上海幼儿师范高等专科学校并入，上海市南林师范学校划归学校管理；1998年9月，上海教育学院，上海第二教育学院并入。

5华东理工大学：1980年8月，上海化工学院恢复华东化工学院原名；1984年，华东化工学院分院（1978年创办）并入上海交通大学机电分校（现上海工程技术大学）；1993年2月华东化工学院更名为华东理工大学；1996年，上海石油化工高等专科学校并入，成立华东理工大学石油化工学院（后改建制为华东理工大学金山校区）；2000年11月，华东理工大学石油化工学院实质性并入；

6东华大学：1980年，上海纺织工学院恢复华东纺织工学院校名；1985年，更名为中国纺织大学；1994年11月，中国纺织总会管理干部学院并入学校；1999年8月，上海纺织高等专科学校（在原上海圣玛利亚女校校址）并入；1999年9月，学校更名为东华大学；同月，国家轻工业局上海玻璃搪瓷研究所并入；2003年5月，东华大学无锡校区并入江南大学。

7上海财经大学：1985年9月，上海财经学院更名为上海财经大学

8上海大学：1978年11月，华东师范大学仪表电子分校、上海科技大学分校、上海外国语学院分院建立；12月，上海机械学院轻工分院、复旦大学分校建立；1983年，筹建上海大学，由校本部和5个学院组成，5个学院分别为原复旦大学分校（1978年12月成立）改为上海大学文学院；原上海机械学院轻工分院（1978年12月成立）改为上海大学工商管理学院（1986年4月改为上海大学商学院）；原上海外国语学院分院（1978年11月成立）改为上海大学外国语学院（1985年6月改为上海大学国际商业学院）；原华东师范大学仪表电子分校（1978年11月成立）和上海科技大学分校（1978年11月成立）以及上海机械学院轻工分院的机械、电子两个专业合并为上海大学工学院；原上海市美术学校改为上海大学美术学院。1993年4月，上海法律高等专科学校并入上海大学；1994年5月，上海工业大学、上海科学技术大学、上海大学、上海科技高等专科学校合并组建为新上海大学。

9上海理工大学：1994年2月，上海机械学院更名为华东工业大学；1993年2月，上海机械专科学校更名为上海机械高等专科学校；1996年5月华东工业大学与上海机械高等专科学校合并组建上海理工大学；1999年，上海光学仪器研究所并入学校；2003年7月，上海医疗器械高等专科学校和上海出版印刷高等专科学校划归上海理工大学管理，部分资源参与组建上海理工大学医疗器械与食品学院和出版印刷与艺术设计学院。

10上海中医药大学：1993年，上海中医学院更名为上海中医药大学；2000年，原上海医学高等专科学校（成立于1985年）并入。

11上海师范大学：1978年4月上海师范学院恢复原建制；1984年10月，正式改名为上海师范大学；1978年，创建上海师范学院分院（1985年定名为上海技术师范学院）；1994年10月，上海师范大学与上海技术师范学院合并成立新的上海师范大学；1997年9月，上海师范高等专科学校、南林师范学校黄陵卫生保健师范部并入上海师大；2000年，上海谢晋-恒通明星学校并入学校；2001年6月，上海市行知艺术师范学校并入，上海师资培训中心划归学校管理；2003年8月，上海旅游高等专科学校划归学校管理；2003年11月，上海教育国际交流中心划归学校管理。

12上海外国语大学：1994年上海外国语学院正式更名为上海外国语大学。

13华东政法大学：2007年3月华东政法学院更名为华东政法大学。

14上海海事大学：1999年，上海港湾学校划归上海海运学院管理；2004年，上海海运学院更名为上海海事大学。

15上海海洋大学：1985年，上海水产学院更名为上海水产大学；2008年，更名为上海海洋大学。

16上海音乐学院：

17上海体育学院：2002年10月，原上海体育学院、上海体育运动技术学院、上海体育科学研究所合并组成新的上海体育学院。

18上海工程技术大学：1978年10月，创建上海交通大学机电分校和华东纺织工学院分院；1984年，华东化工学院分院并入上海交通大学机电分校。1985年，在两校合并基础上正式成立上海工程技术大学；2003年1月，上海市高级技工学校划入学校，组建了上海工程技术大学高等职业技术学院和上海高级技师学院。

19上海戏剧学院：2002年6月，原上海师范大学表演艺术学院并入上海戏剧学院，作为戏曲舞蹈分院。上海市戏曲学校、上海市舞蹈学校成为上海戏剧学院附属戏曲学校和附属舞蹈学校。

20上海对外经贸大学：2013年1月上海贸易学院名为上海对外经贸大学。

21上海电力大学：1985年1月，上海电力专科学校升格为上海电力学院；2018年，更名为上海电力大学。

22上海政法学院：1984年11月，上海市政法管理干部学院创建；1985年，上海法律专科学校建立，与上海市政法管理干部学院合署；1992年，上海法律专科学校更名为上海法律高等专科学校；1993年4月，上海法律高等专科学校和上海大学文学院法律系合并成立上海大学法学院；2004年9月，撤销上海市政法管理干部学院和上海大学法学院建制，以两院为基础设立上海政法学院；2008年，上海市司法学校并入上海政法学院。

23上海立信会计金融学院：1992年4月，立信会计专科学校更名为立信会计高等专科学校；2003年9月升格为上海立信会计学院。1982年，上海财政金融学校改建为上海银行学校；1987年，升格为上海金融专科学校；1992年4月，更名为上海金融高等专科学校；2003年9月，升格为上海金融学院。2016年3月，上海立信会计学院和上海金融学院合并组建上海立信会计金融学院。

24上海应用技术大学：1990年10月，上海冶金专科学校与上海第二冶金专科学校合并成上海冶金高等专科学校（校名1991年9月启用）；1992年4月，上海轻工业专科学校更名为上海轻工业高等专科学校；1992年4月，上海化学工业专科学校更名为上海化工高等专科学校；2000年4月，上海轻工业高等专科学校、上海冶金高等专科学校、上海化工高等专科学校合并组升格为上海应用技术学院；2006年2月，上海香料研究所、上海市日用化学工业研究所并入学校；2016年3月，上海应用技术学院更名为上海应用技术大学；同年，上海市材料工程学校由上海应用技术大学托管。

25上海第二工业大学：1984年7月，上海市业余工业大学改名为上海第二工业大学；2000年7月，学校由成人高校系列转制为普通高校系列；2001年11月，学校与上海东沪职业技术学院（1999年8月由上海冶金联合职工大学和上海冶金工业学校合并建立）合并组建成新的上海第二工业大学。

26上海电机学院：1987年，上海市第一机电工业局职工大学闵行分部（成立于1982年）并入上海电机制造学校；1992年，上海电机制造学校更名为上海电机技术高等专科学校；1998年，上海机电工业职工大学一分校（成立于1978年）和上海机电工业职工中等专业学校（成立于1983年）并入；2004年3月，上海机电工业职工大学（成立于1987年）、上海市机电工业学校（成立于1951年）并入；2004年9月，升格为上海电机学院。

27上海商学院：1983年8月，成立上海市财贸管理干部学院，并设有中共上海市财贸党校。1994年10月，上海市财贸管理干部学院与市商业一局职工大学、市粮食局职工大学、市供销社职工大学合并，筹建上海市商业高等职业技术学校，保留上海市财贸管理干部学院建制；1998年3月，正式建立上海商业职业技术学院（1997年9月名义为信会计高等专科学校）；2004年9月，升格为上海商学院；2016年，上海市商务教育培训中心（上海市商业人才开发服务中心）并入上海商学院。

28上海公安学院：1983年11月，上海市公安学校升格为上海公安专科学校；1992年4月，改名为上海公安高等专科学校；2017年6月升格为上海公安学院。

29上海海关学院：1980年5月，以上海海关学校为基础，改建为上海海关专科学校；1996年4月上海海关专科学校改名为上海海关高等专科学校；2007年3月升格为上海海关学院。

30上海健康医学院：1999年，上海第二医科大学卫生技术学院成立；2005年9月，在此基础上建立上海医药高等专科学校⑴。1981年，上海医疗器械工业专科学校更名为上海医疗器械专科学校；1992年，更名为上海医疗器械高等专科学校⑵；2003年5月，学校划归上海理工大学管理（一套班子、两块牌子）。1983年，上海卫生干部进修学院更名为上海卫生职工学院；1985年，更名为上海职工医学院；2010年，转型更名为上海健康职业技术学院⑶。1989年，上海第二医科大学附属新华卫生学校（创建于1957年）、瑞金医院护士学校（创建于1936年）、上海市第九人民医院护士学校（创建于1920年）合并组建上海第二医科大学附属卫生学校；1995年，学校同上海市崇明县卫生学校联合办校，成立上海第二医科大学附属卫生学校崇明分校；1998年9月，上海市嘉定区卫生学校（创建于1958年）并入；2005年，上海第二医科大学附属卫生学校改建为上海交通大学医学院附属卫生学校⑷。1998年，上海市第一人民医院护士学校并入上海市卫生学校⑸；2001年，上海市杨浦区卫生学校并入上海市卫生学校；2003年，上海市卫生学校同上海市崇明县卫生学校联合办校，成立上海市卫生学校崇明分校。2015年5月22日，由原上海医药高等专科学校⑴、上海医疗器械高等专科学校⑵和上海健康职业技术学院⑶合并组建上海健康医学院，同期由原上海交通大学医学院附属卫生学校⑷和上海市卫生学校⑸合并组建成立上海健康医学院附属卫生学校；同年，上海市奉贤区中心医院（市第六人民医院南院）成为上海健康医学院附属医院。

31海军军医大学：1999年，海军医学高等专科学校并入第二军医大学。2017年6月第二军医大学更名为中国人民解放军海军军医大学，对外保留第二军医大学校名。

32上海科技大学：2013年9月正式建立上海科技大学。