朱翊钧对张居正的依赖由此可见一斑，但此事却也为后来朱张关系的决裂埋下了伏笔。

1578年，张居正的母亲进京，受到了皇室极高规格的接待，在面见太后时，被恩准以家人的礼节行礼。朱张关系到达顶峰。

1582年，张居正长眠，永远地离开了朱翊钧。此时，当年的小皇帝已然20岁，他一方面缅怀这位严厉的张先生，另一方面，苦学多年终于到了独当一面施展拳脚之时。朱翊钧迫切地想当一位名副其实的明君。

遗憾的是，吃了道行浅的亏，此时他还未意识到随着张居正撒手人寰朝堂内已分为两派：一派反张，一派拥张。

如此一来，朱翊钧的一言一行都极易被有心人加以放大，他的一道诏书便被反张派拿来大作文章。这道诏书如下：“之前丈量土地时存在不少弊端，出现不少虚报、多报、谎报耕地面积的情况。”朱翊钧的本意只为彰显自己敏锐的洞察力，只字未提张居正，但是反张派却以过去这项工作是张居正负责为由，进而攻击拥护张居正的官员，大批的官员被迫下岗，反张浪潮掀起。

星星之火一旦出现，火势很快便蔓延开来。张居正去世不过半年，便被以各种借口安上贪恋权欲、欺上犯下、结党营私、徇私舞弊等罪名。

三人成众，在种种反张言论下朱翊钧陷入了迷茫。过去张先生时时刻刻督促自己用功，还让自己要厉行节俭当一个明君，可他所作所为却完全背道而驰？

1583年，朱翊钧亲自主持的殿试中所出的题目，十分写实地反应了他内心的挣扎。“为什么朕越想当一个好皇帝励精图治，结果却适得其反？是朕没有仁民爱物的精神？还是朕的性格本就优柔寡断？”

皇帝往往也是最悲哀的，人人都可以错，皇帝却不被允许。在张居正长眠后的两年内，大批与他有关的官员被清理出场，万历皇帝的内心亦备受煎熬，往事历历在目，种种复杂的心情在他脑海中翻滚。

终于在1584年，朱翊钧铁下了心，继撤了张居正三个儿子的官职后，再度下令查抄他的家产。此举无异于彻底给张居正戴上了一顶反派的帽子，一朝忠良死后含冤。