朝阳站将传统北京建筑文化与现代建筑样式结合，融入了“灰砖、红墙、金瓦”等北京元素。目前站前广场还未修建完成，仍以绿膜铺盖地面。

朝阳站共设3层，分别是地下层、地面层、高架层。地面层为列车始发及终到站台层，同时也是公交车、自行车、步行等交通方式的进站口；高架层是出租车和社会车辆的落客区，也是候车厅所在层；地下层设有快速进站口，也是市郊铁路的入口，未来可以换乘地铁。

乘坐公交到达朝阳站后，需再乘坐电梯到地下，通过地下通道前往安检口，安检后可直接在地下进站，或上到二楼候车厅候车。