关于质能关系的一个误解是把核反应的能量释放过程按照公式 E=Δmc^² 解释成了质量转化成了能量。其实，Δm 是反应前后粒子 (们) 的质量差，这个过程释放的是结合能。 E=Δmc^² 的意思是，结合能部分在反应前的粒子里贡献了大小为 E/c^² 的质量，这恰是诠释质量起源会用到的那套语言。 Δmc^² 反映的恰是原子核层面及其下的结合能远大于原子、分子层面的结合能。 当我们反过来理解质量大于质量总和，也即能量成了质量起源的时候，会有另一种感觉。质能关系可用于理解核过程的能量释放问题，它也提供了粒子质量来源的问题—基本粒子每一个层面的质量都大于下一层面单元的质量总和，差别来自将构成单元结合到一起所需的能量。这个逻辑链条的尽头，一定着落到一个无质量的构成单元上。

必须指出，理解物理要尽可能依托完整的物理图景，不可以在局部上任意发挥而罔顾学问整体上的自洽性。公式

表达的是一个质量为m的粒子运动时的能量，数学上是个 E=E（v） 的函数，不可以把它总按照 E=mc^² 来理解得到一个质量随速度的变化—这种理解从数学、物理两个方面来看都是不合适的。粒子的质量，如同粒子的电荷、自旋，是粒子的标签。粒子质量就是静止质量，它是个不变量。公式

描述的是质量为m的粒子在给定参考框架内运动状态下所具有的能量。特别地要指出，把质量概念应用于光子更加需要谨慎。光子有能量，速度始终为c且没有参照物。笔者以为，不是光子是零质量粒子，而是关于光子，质量的概念无从谈起 （试看它的洛伦兹变换）！关于相对论语境下的能量问题，包括能量的转化与守恒，需要用严谨的动量4-矢量和能量-动量张量的相对论理论加以理解。具有动量p的质量为m的粒子，其能量-动量关系为 E^² =p^²c^² m^²c^⁴ (Dirac, 1928)，这才是正确的物理表述。