在MOE分析中还发现了两个疏水性残基,即Met-134OmCI和Leu-140OmCI。它们都邻近带电残基(分别是Asp-135OmCI和Glu-141OmCI),可能被认为降低了它们极性邻居的脱溶或构象熵。曾预测L140G将是第三个最有效的突变,作为单一突变,它在很大程度上没有效果,在组合使用时只有轻微的贡献。
单独的M134G突变几乎减弱了结合,CD和DSC数据表明,这可能是由于由于二级结构丧失而引起的不稳定性。Met-134位于一个β-折叠末端,插入一个灵活的甘氨酸残基可能在这个位置上难以耐受。
Met-134标志着BH-α3的结束,这是一个主要是疏水性的环,L140G位于其中,将OmCI的大α3螺旋与β桶折叠连接起来。在与C5复合物中,这个环位于C5d结构域上的一个疏水通道中,由Ala-1216C5–Val-01218C5和Ser-123C5–Val-1239C5所界定。
该区域是疏水性的,似乎在骨架基团之间形成链间氢键。这些不是侧链相互作用,随后不能突变轻易地进行研究,它们仍然可能对结合的自由能产生显著贡献,疏水环境确保了低脱溶熵。
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