故事简要：
所有人类的灵魂都是海里一条巨大的鱼，出生的时候从海的此岸出发，在路途中，有时相遇，有时分开，死的时候去到海的彼岸，之后变成一条沉睡的小鱼，等待多年后的再次出发，这个旅程永远不会结束，生命往复不息 。十六岁生日那天，居住在"神之围楼"里的一个名叫椿的女孩变作一条海豚到人间巡礼，被大海中的一张网困住，一个人类男孩因为救她而落入深海死去。为了报恩，为了让人类男孩复活，她需要在自己的世界里，历经种种困难与阻碍，帮助死后男孩的灵魂——一条拇指那么大的小鱼，成长为一条比鲸更巨大的鱼并回归人间 。
误区
首先我要纠正几个误区：
①椿接触凡人触发天规，而不是养鱼。
②椿打算跟湫在一起，他们是生死与共的伙伴。
③湫送给椿的鬼脸是人间信物。
④湫没有死，他代替椿成为鱼婆的接班人。
⑤湫并没有被椿拒绝，而是被椿表白。
⑥开天用的是湫奶奶的拐杖，不是龙王面具。
⑦两个世界相连后，椿不和鲲一起走也不会死。
⑧湫化成的人间风雨不是人间信物。
⑨灵婆是天神，她发动了洪水。
在海底深处，有另一个世界。居住在那里的人，被称之为其他人。他们既不是人，也不是神。其实，他们是鬼
为何说其他人是鬼呢？
鲲是一个人类男孩，为救一条红海豚溺水而死。大家是否注意到：因为椿和鲲是两个世界的人，他们始终不能以同一种形态相处，必须有其中一方变成鱼。中元节俗称鬼节。鬼门大开，百鬼夜行。成人礼时，椿见到人间的河灯，这是中元节的传统。结合这些，我推测，所谓红色的海豚，其实是鬼怪的化身。
中元节的河灯推断 红色的海豚是鬼
大家不妨想想《千与千寻》，千寻闯入的浴场，里面净是些鬼怪。船夫三手和千寻遇到的鬼怪酷似，实际上它们来自《山海经》中同一个原形。
船夫三手 《山海经中》椿接触人类触犯天规，而非养鱼。
海底世界的成人礼是去人间视察自然规律。长辈们不断嘱咐：外面的世界很危险，决不能与人类接触。可是，信物必须是接触人类后，从凡人手中得到的才算是"人间"信物。随便捞点贝壳可不算哦。天神制定天规，统治着海底世界。得到人间信物的代价首先是违反天规。如此说来，人间信物是违反天规的证据。
人间信物 违反天规的证据
鱼婆一眼看中这陶笛。这个"信物"证明椿与人类有过接触，从而让鱼婆晓得了椿已触犯天规。于是，鱼婆将椿约到如升楼来，与她交易，选椿做她的接班人。
我想在座各位，看完影片的第一印象是——椿私自养鱼，触犯天规，引发灾难。在族人的暗示下，椿也开始以为灾难是由"养鱼"引起的。（呵呵）真的是所有人吗？我们看看鱼婆对灾难的评价：
鱼婆对灾难的评价
"下面脏东西不少，该好好洗洗了。"一副幸灾乐祸的样子。
鱼婆引发洪水
湫第一次开天失败，以至于海水倒灌。而用鱼婆的核桃却轻易开启海天之门，期间没有引发大水，更没有任何不良反应。（化为秋叶是吞下核桃后的事。）这个核桃是鱼婆送的。这么说来鱼婆开海天之门一点都不费劲。估计发个洪水和冲个厕所的感觉是一样的吧……
湫用核桃打开 海天之门
鱼婆有动机清洗脏东西，故意降灾。也有能力开启海天之门，引发洪水。由此推测，洪水是由鱼婆引发的。那么，既然接触凡人已触犯天规，那么椿是否养鱼都会有灾难发生。因此，鲲为鱼婆的洪水背了黑锅。鱼婆见到洪水发生很满意。灾难结束后，洪水正好淹到貔貅所在的断桥位置，水位也不会影响如升楼。结合那些破败的土楼废墟，再回味鱼婆修炼的800年，细思极恐。
鱼婆告诉湫，大鱼送走后椿就会死。当时的情况是：大鱼和椿性命相连，并且两个世界是分开的。大鱼变回人，中间的连接中断，椿就会死。
可是到最后：两个世界相连，椿和鲲的连接不会断。所以椿不去人间也没关系。但湫并不知情。鱼婆借椿养鱼，掩护自己发洪水，送鼠婆回人间，并培养接班人。鱼婆的目的是培养接班人；鼠婆的目的是"回人间"。
去人间需要车票和通道。最后送走椿和鲲时，两个条件都具备。湫在中毒后送给了椿的"鬼面挂饰"就是人间的信物。所谓的"人间风雨"不是信物，只是湫安慰椿的说法。这次旅程很顺利，除了湫自己"火化"外没什么损失。片尾彩蛋里，湫被鱼婆复活，成为下一任鱼婆。
鼠婆回人间
那么椿第一次尝试送鲲回去，为何没去成呢？鼠婆大摇大摆地去了人间，鲲没去成摔了下来。鼠婆用的"回"字。看来鼠婆原本就属于人间。不像椿结尾需要变成海豚。龙王面具碎后，湫还能勉强维持海天之门。召唤龙王的是拐杖，面具只是防具，用来抑制法杖的负面效果。
龙王面具碎掉通道勉强维持拐杖脱手湫开天失败，最终法杖脱手。施法被打断；湫的"通道"无法维持；椿的人间也没去成。
鼠婆
爷爷说人死后的灵魂变成小鱼归灵婆管。灵婆甲掌管鱼，是鱼婆。灵婆乙掌管老鼠，是鼠婆。灵婆只是个职位，不是人名。大家说起灵婆，一般指的都是鱼婆。人死后灵魂变成小鱼，坏人的灵魂变成老鼠。鱼可以再投胎成人，老鼠则不能。鱼婆的接班人本来是椿，湫和鱼婆交易赎回了椿的寿命，成为鱼婆的接班人。那么鼠婆走了，谁来接班呢？
鼠婆和那些小老鼠都一样，都来自人间。不同的是，她还活着。鼠婆的封印应该和鱼婆过往的经历有关。眼前的这位老妪~她可不是鼠婆哦，充其量算个傀儡吧。我推测，鼠婆的本体，就是背后"打伞鼠"。鼠婆只是个可怜的傀儡。真正控制老鼠的，是背后那只阴森森的硕鼠。鼠婆回到人间，重获自由，并不需要谁接班。
鼠婆的秘密
鼠婆回到人间，同时带走了一个秘密——鼠婆、鱼婆二人皆为灵婆！都是掌管死者灵魂的鬼婆。
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