可以分开，仓鼠妈妈咬自己的孩子有可能是在分娩期间受到了惊吓的原因引起的，仓鼠在分娩的时候需要选择安全过关的地方，而且不要频繁的喂养或者是逗它。

也有可能是在喂养孩子的时候被吓到导致的，当仓鼠妈妈缺少营养或者是小仓鼠身上有其他的味道，都有可能会导致仓鼠妈妈咬孩子的情况。

小仓鼠被母仓鼠咬伤了,那么这种情况,建议最好进行隔离,考虑到仓储过小,那么这种情况建议在18天到20天后分笼饲养。