塞舌尔位于印度洋西部的群岛上，距非洲大陆1500公里，西南距马达加斯加900余公里，南与毛里求斯隔海相望，距印度2800多公里，由大小岛屿115个组成，主要分成两大部分：北方32个岛屿组成的马埃群岛多为花岗岩岛。南方83个人烟稀少的岛屿则为珊瑚岛。以马埃岛最大，面积148平方公里。全部岛屿分为4个岛群：马埃岛及其周围卫星岛；锡卢埃特岛和北岛；普拉斯兰岛群；弗里吉特岛及其附近礁屿。塞舌尔山为马埃岛上最高点，海拔905米。

全境多丘陵山地，无河流。属热带雨林气候，一年只有两个季节：热季和凉季。终年高温多雨。

岛屿周围有200海里经济区，盛产金枪鱼。