格列佛在一艘开往黎凡特的船上。抵达后，格列佛被指派为单桅帆船的船长，前往附近的岛屿并建立贸易。在这次旅行中，海盗袭击了单桅帆船，并将格列佛安置在一艘小船上自生自灭。在海上漂流时，格列佛发现了一个飞行岛。在名为拉普达的飞行岛上，格列佛遇到了包括国王在内的几位居民。所有人都全神贯注于与数学和音乐相关的事物。而天文学家则利用磁力定律从而控制岛屿的运动。

在这片土地上，格列佛访问了巴尔尼巴比、格鲁布杜布德里布岛和卢格纳格。多日后，格列佛终于抵达日本，在那里他遇到了日本天皇。从那里，他去了阿姆斯特丹，最终回到了英国。

当格列佛是一艘开往巴巴多斯和背风群岛的商船的船长时，他的几名船员在航行中生病并死亡。格列佛在巴巴多斯雇佣了几名替代水手。这些替代者原来是海盗，他们说服其他船员叛变。结果，格列佛被安置在一个岛屿上自生自灭。

很快他就被一群丑陋、卑鄙的人形生物发现了，他后来才知道，这些生物被称为雅虎。他们通过爬树和在他身上排便来攻击他。他因一匹马的出现而停止这种耻辱，后来他才知道，这匹马的名字叫霍伊恩姆。灰马把格列佛带到他的家，在那里他被介绍给灰母马（妻子），一匹小马驹（孩子），以及一个酢浆草唠叨的仆人。

格列佛还看到雅虎一家被关在远离房子的围栏里。很明显，除了格列佛的衣服，他和雅虎是同一种动物。从这一点开始，格列佛和他的主人（灰色）开始了一系列关于雅虎演变的讨论，关于格列佛所代表的雅虎社会的话题、概念和行为，以及关于霍伊恩姆社会的讨论。

尽管格列佛在灰骏马的家中受到优待，但王国议会决定格列佛是雅虎，要么与未开化的雅虎生活在一起，要么回到自己的世界。格列佛怀着极大的悲哀告别了霍伊恩家。

他建造了一艘独木舟，航行到附近的一个岛屿，最终被一艘葡萄牙船上的船员发现。船长将格列佛送回里斯本，他住在船长的家中。格列佛对他们的视觉和气味感到非常反感，以至于他无法忍受在他们身边。最终格列佛同意回到英国的家人身边。

《格列佛游记》在当时是独一无二的;它不是为了求爱或娱乐而写的。这是一份起诉书，在被起诉的人中最受欢迎——即政治家、科学家、哲学家和一般的英国人。

斯威夫特本人也承认，他想用他的讽刺来“烦恼”世界，当然，从他的语气中，最能感受到他的意图。原著的语气从温和的机智到彻头彻尾的嘲讽不等，但始终存在一定的嘲讽。

鲍德勒博士把它的讽刺作品改编成一本儿童读物。在那次文学操作之后，原始版本在很大程度上被普通读者所丢失。因为维多利亚时代为家庭图书馆购买的《游记》是鲍德勒的版本，而不是斯威夫特的版本。具有讽刺意味的是，鲍德勒会为了得到一个他认为最适合公众消费的版本而清洗《游记》

因为最初，这本书被公众如此热切地购买，以至于书商正在提高这本书的价格，确保在这本书上多赚几块钱。而后来的情况是，不仅受过教育的人购买并阅读了这本书，大部分没有受过教育的人也是如此。