刺客信条黑旗的操作基本上继承了刺客信条3代，在玩法上系列首次加入了海战以及动态天气系统。

海战玩法的加入，让游戏获得了更高的自由度，玩家能够探索达到的地方更远、更多。海战的玩法也应用到了后续的作品中，但都是阉割版。所以严格意义上来说，刺客信条黑旗更像是一个海盗游戏。

主角爱德华可以同时佩戴4把单发手枪，一把双持佩剑、一条钩锁以及烟雾弹、毒箭等武器，不同的武器之间可以打出combo的处决动画。

海战玩法，需要玩家通过海上掠夺、交易来获取升级船只的材料。每次升级船体，船的外形会发生改变，你也可以收集购买装饰品来装点船只。到最后，你可以驾驶着豪华三列炮台的巨舰，炮轰港口、碉堡横扫加勒比海。

自刺客信条黑旗后，旧刺客系列游戏的剧情、玩法出现严重的下滑。再也没有出现过剧情与玩法都不错的系列作品。

大革命与枭雄中的剧情薄弱；叛变剧情虽然还不错，但玩法却过于单调。

如今刺客信条的第十三部正作即将发售。从宣传片中我们能看出，育碧在玩法上似乎回到了老刺客中。