枯草芽孢杆菌是一种生物制剂，对作物、对土壤都有很好的生长调节作用，基本是多功能的，重要的是它的使用效果是累加的，是单纯的肥料或激素达不到的。

1、抗生作用：是指抗微生物通过产生代谢产物，在低浓度下，就能够对病原微生物的生长和代谢产生抑制作用，从而来影响病原微生物的生存和活动。

2、溶菌作用：主要表现在是通过吸附在病原菌的菌丝上，并随着菌丝生长而生长，而后产生溶菌物质造成原生质泄露，使得菌丝体断裂。

3、诱导植物产生抗性及促进植物生长：指枯草芽孢杆菌不但能够抑制植物病原菌，而且还能够诱发植物自身抗病机制，从而增强植物的抗病性能的作用。

其中以枯草芽孢杆菌的抗逆性最强、功能最多、适应性最广、效果最稳定。枯草芽孢杆菌能够产生类似细胞分裂素、植物生长激素的物质，促进植物的生长使植物抵抗病原菌的侵害。

4、保护环境：枯草芽孢杆菌大量应用于生物肥料。当作用于作物或土壤时，能够在作物根际或体内定殖，并起到特定肥料效应。

目前，微生物肥料在培肥地力，提高化肥利用率，抑制农作物对硝态氮、重金属、农药的吸收，净化和修复土壤，降低农作物病害发生，促进农作物秸秆和城市垃圾的腐熟利用。提高农作物产品品质和食品安全等方面表现出了不可替代的作用。

5、枯草芽孢杆菌对土壤微生物的呼吸强度的影响：土壤呼吸强度作为土壤生物活性指标之一，能够在一定程度上反应土壤营养物的转化和供应能力，其呼吸速率变化及变化方向也反应了生态系统对胁迫的敏感程度和响应模式，是环境安全评价的一项重要指标。

当土壤受到外来污染物污染时，微生物为了维持生存可能需要更多的能量，而使土壤微生物的代谢活性发生不同程度的响应。

研究表明各质量分数处理的枯草芽孢杆菌均表现为对土壤呼吸作用的刺激效应，并且土壤中枯草芽孢杆菌质量分数越大，对土壤呼吸强度的刺激作用越大，即刺激强度和施药质量分数呈正相关。

6、枯草芽孢杆菌对土壤脲酶活性的影响：应用土壤酶作为监测指标，评价农药的生态毒理效应已成为环境科学领域的研究热点之一。

而脲酶属于土壤中研究得比较深入的一种水解酶类，是惟一对尿素在土壤中转化及尿素利用率有重大影响的酶。

尿素施人土壤后，在脲酶的催化作用下，迅速分解成二氧化碳和氨，所以土壤脲酶活性的降低，不仅可使尿素水解减缓，令其水解产物更多地被土壤吸附而有效减少尿素水解产物氨的挥发损失，也可能相应减少水解产物NH硝化作用潜势。

7、枯草芽孢杆菌对盐碱地的改良：土壤内盐分积累的危害 土壤结构黏滞，通气性差，容重高，土温上升，好气性微生物活动差，养分释放慢，渗透系数低，毛细作用强等，导致表层土壤盐渍化进一步加剧，造成土壤冷、硬、板现象。

一般说来，当土壤表层或亚表层中的水溶性盐类累积累超过0.1％，或土壤碱化层的碱化度超过5％，就属于盐渍土。