当人体因为某些疾病和生理紊乱对各种成分的代谢产生异常时，这些成分就容易在泌尿系统中异常堆积，形成结晶，最终发展为结石。

高钙尿症、高尿酸血症、高草酸尿症和胱氨酸尿症等疾病都会导致人体对于某些成分代谢异常，增加结石的发生风险。

尿路梗阻和尿路感染

尿路梗阻会导致尿液排出不畅，部分尿液浓缩后其中的结石成分沉淀，最终形成结石。

另一方面，结石本身也是造成尿路梗阻的原因之一，会加重尿路梗阻。而尿路感染有时也会造成尿结石的产生，当细菌将尿素分解后，就容易使尿液碱化，导致感染性结石——碳酸磷灰石的形成。

气候因素

环境与气候同样与尿结石的发生存在着关联性。尿结石的形成呈现明显的地域差异，就比如我国南方尿结石的发病率可达10%以上，要远高于北方。而一项发表于《科学报告》（Scientific Reports）上的研究指出了美国东部地区温湿度与肾结石发病率之间存在的关联性。

研究发现，该地区的气温受全球变暖的影响每年都会上升，而肾结石的发病率平均每年也会增加1%。之所以会呈现这种差异，主要是因为在温度较高时，人体会通过排汗与呼吸流失更多的水分。这就导致尿液浓缩，其中的代谢产物更容易在体内沉积，最终形成结石。

饮食的影响

饮食与泌尿结石之间存在着不可不说的关系，首先饮水过少就容易导致尿液浓缩，增加结石发生的可能性。再者，不少食物中含有的成分，也会导致某些结石成分的含量在人体内激增。

比如许多绿色蔬菜含有草酸，许多动物内脏含有较高的嘌呤，嘌呤在代谢后会形成尿酸。

服用某些药物

某些药物在服用后会增加结石成分的排泄率，比如维生素C服用过量时，尿液中的草酸含量也会增加。再者，某些药物本身就是结石的成分，比如磺胺类药物。