孔提生性偏激，在加入少林不久便犯寺规，被逐出少林，随后加入江湖组织日月教，并与教主女儿海明成亲。

白世芬在少林习得高深武功，并结识一烧火僧人尚悟真（罗乐林饰）。尚悟真实乃康熙四子胤禛，其混入少林便是为了盗取《洗髓经》。

白世芬被派遣下山寻找《洗髓经》，结识一生至爱楚梦色（梁小冰饰），却遭到连坤追*。原来楚梦色是连坤之妻，因从连坤处偷习《洗髓经》才得以保住青春。

白世芬在梦色的相助下，终将《洗髓经》送回少林。

时值康熙驾崩，胤禛登位，即为雍正帝。雍正为求长生不老，派连坤向少林索取《洗髓经》。白世芬为保《洗髓经》和梦色，成为朝廷钦犯，家门因此罹难。

白世芬幸得孔提相助逃得一劫，而日月教却因此被剿。孔提一蹶不振，流浪街头，白世芬则藏身于南少林。

在南少林叛徒恒道（欧瑞伟饰）的告秘下连坤终知白世芬下落，并下令火烧南少林。白世芬携南少林弟子一路奋战，终回北少林……

《武尊少林》在传入内地时曾改名为《少林风云》，该剧无论剧情、配乐还是打斗都是上乘之作。