广州地铁13号线首期工程线路起于鱼珠站，之后向南后转向东先后下穿鱼珠木材厂、煤炭厂、省糖铁路支线三条铁路线，两次穿越狮子桥涌后沿规划路、海员路向东到达丰乐路，截至沿规划路向东，线路出夏园站后沿107国道向东行进，跨过黄埔新港支线铁路、开发大道，在金竹山路东侧钻处地面，折向东北跨过东鹏大道到达南岗站。

沿广深公路向东北行进，跨过罗南路折向东接入规划路，线路在107国道之前进入地下，之后线路下穿广深高速接入新塘大道，过东洲后折向北，穿广深高速接入107国道，最后线路向东，到达新沙站。共11个站。

北京地铁13号线是由东直门，柳芳，光熙门，芍药居，望京西，北苑，立水桥，霍营，回龙观，龙泽，西二旗，清河站，上地，五道口，知春路，大钟寺，西直门。