吏部

明朝吏部有尚书（正二品）一人，左右侍郎（正三品）各一人。

下设四个清吏司（文选、验封、稽勋、考功），每司各有郎中（正五品）一人，员外郎（从五品）一人，主事（正六品）一人等官。

吏部职权特重，为六部之首。

户部

明朝户部有尚书一人，左右侍郎各一人。

明朝户部下设十三清吏司（浙江、江西、湖广、陕西、广东、山东、福建、河南、山西、四川、广西、贵州、云南），各司有郎中、员外郎、主事等官。

户部另有一些直辖机构，如宝钞提举司、广盈库、军储仓等。

礼部

礼部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设四个清吏司（仪制、祀祭、主客、精膳），各司有郎中、员外郎、主事等官。

另辖铸印局等。

兵部

兵部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设四个清吏司（武选、职方、车驾、武库），各司有郎中、员外郎、主事等官。

另辖会文馆等机构。