1998年2月18日，上海大众第100万辆轿车下线；同年桑塔纳2000GSi“时代超人”投放市场；

随着中德双方合作的不断深化和车型技术含量的不断提高，上海大众越来越重视对引进技术的消化吸收和人才培养。1998年6月11日，上海大众首批21名培训人员前往德国接受为期三年的全过程开发综合培训。这一人才培训计划表明上海大众开始向汽车全过程自主研发能力进行前期人员储备。

1999年12月15日，上海大众汽车三厂全面建成投产，首辆帕萨特轿车下线。这款帕萨特是以德国大众1996年推出的帕萨特B5为蓝本，为了适应中国国情轴距加长100mm后的中国规格的帕萨特。

在当时帕萨特算是技术含量很高的车型，基本款GLS搭载1.8L和2.0L发动机。很快上海大众又推出了匹配1.8T和2.8L V6发动机的车型。配置有四车门电动防夹手车窗、方向盘可4向调整、全车八喇叭音响、后遮阳窗帘、后座中央扶手、电动可加热车外后视镜、电动中央门锁。高级别的配置包括：桃木饰板、真皮座椅、自动恒温空调、六碟CD机、电动8向司机座椅、定速巡航系统……，可以说在当时除了一汽-奥迪的A6，帕萨特算是技术水平最高的国产轿车，它的推出标志着上海大众已拥有生产技术先进的中高级轿车并进行结构改进的能力。

2001年12月30日，上海大众汽车首辆Polo轿车下线。Polo虽然是一辆经济型小车，但它投产的意义并不亚于帕萨特。这是因为这辆Polo是上海大众第一辆“零时差”引进的车型，也标志着过去只能引进国外过时车型的时代已经过去，而这也说明了德国大众越来越重视中国市场。