菠萝蛋白酶可通过促进细胞处于静止状态、促进细胞恢复、降低升高的 IL-6 水平，和减少细胞凋亡，来帮助控制过度纤维化。

→影响白细胞活动

菠萝蛋白酶还被发现，会干扰 P-选择素（一种内源性凝集素）的，中性粒细胞结合位点。

从而限制中性粒细胞与底物的结合，减少炎症，并减少糖尿病和其他炎症状态下，细胞的糖基化。

菠萝蛋白酶可能影响各种白细胞表面，从而影响它们的活化和迁移，中性粒细胞趋化性，以及白细胞与血管的粘附。

这些都是有助于抗水肿、抗炎和抗纤维化作用的机制，细胞表面成分也受菠萝蛋白酶影响，比如l-选择素。

→减轻剧烈运动带来的损伤

适度运动对免疫系统有积极作用，但剧烈的运动的负荷太大，反而会损伤免疫系统。

比如马拉松跑步，会引起炎症增加，并与上呼吸道感染（URI）的发生率增加有关；也可能对肌肉造成创伤，并促进血栓前状态。

对马拉松运动员的研究表明，菠萝蛋白酶发挥抗炎和纤维蛋白溶解作用，使白细胞介素和免疫球蛋白A正常化，从而使剧烈运动导致的炎症正常化。

另一项研究表明，菠萝蛋白酶可以减轻，由于不习惯的运动引起的骨骼肌损伤。

菠萝蛋白酶也被证明，可以减轻疲劳，并在耐力运动员中显示出，维持血清睾酮浓度的趋势。

→可能有助于预防癌症

有研究发现，菠萝蛋白酶具有天然的抗癌作用，包括促进凋亡细胞死亡，和防止肿瘤生长。

动物研究表明，它可以诱导产生不同的细胞因子，具有抗转移功效，并且通过减少血小板聚集，来抑制癌细胞转移。

→帮助治疗消化系统疾病

菠萝蛋白酶是一种特别有助于消化蛋白质的酶，并且已被发现，可以帮助身体更有效地吸收营养甚至药物。

研究表明，它可以减少结肠炎症，减少损害肠道内壁的促炎细胞因子的分泌，在治疗胃肠道内组织方面非常有效，因此对有以下胃肠道问题的人有益：