小说末尾，阿斯瑞尔勋爵与一群叛变天使结盟，领导“共和军”同天国摄政王梅塔特隆的军队激战。最后，代表人类的阿斯瑞尔勋爵和库尔特夫人一起将代表天堂的梅塔特隆引诱至混沌深渊（Abyss），三人在那里同归于尽，世界的原有秩序被打破重构，出现了一个没有国王、主教、神父的理想共和国。

再加上原作者菲利普·普尔曼曾经承认自己是一个无神论者，让《黑暗物质三部曲》成了那些宗教狂热分子的攻击对象，在一些保守的北美教区甚至成了禁书。

最后笔者想说，幻想作品就是幻想而已。在宗教狂热主义者眼里，任何有悖教义的作品都可以被解读为“异端邪说”：80年代北美教会曾经将“龙与地下城”（D&D）这款桌面游戏定性为蛊惑年轻人的“撒旦教材”；甚至90年代从日本传到北美的“口袋妖怪”都曾遭到批评，说那是“否认上帝存在的东方恶魔”，简直滑天下之大稽。笔者敢打赌作出这些批评的人根本不曾了解过“D&D”和“口袋妖怪”，当然他们也没有必要去了解，因为批评本身就代表了一种正确，利用无知和所谓“虔诚”来控制人们并以此牟利早就不是什么新鲜手段了。