香港警察协会则致信段崇智，对其在公开信中的指责做出正面回应。
警察协会认为，求证求真是科学精神的根本，段崇智身为一位科学家竟然忽视如此重要的原则，仅凭被捕学生的片面之词便公开质疑警方，令人极度遗憾。
信中还称，段崇智作为大学校长，理应引导违法学生为过错承担法律责任，而不是以大学之名及公信力包庇他们。段崇智这种做法是自毁大学公信力，“可以说，段崇智作为大学校长开了一个很坏的先例。”
一波未平一波又起。
11月12日起，港中大再次沦为“战场”。大批黑衣暴徒连续两天攻占校园，四处点火疯狂破坏，并向警方投掷燃烧弹，偷取校园弓箭、标枪用作武器与警方对峙。据香港《明报》消息，港中大暴徒当天投掷出200多枚汽油弹。
校园内暴徒手持弓箭对峙。
乱局迫使学校紧急停课，大批内地学生人身安全受到威胁，不得已逃离校园前往深圳。
面对一盘散沙的校园，段崇智仅仅在12日晚短暂露面，企图调停暴徒与港警的对峙无果后，便全然不见踪影。
段崇智与暴徒对话。
几天后，他更是以生病入院为借口，彻底把自己置身事外。
不露面、不谴责、不作为，这样的“三不校长”自然招致本校师生不满。
11月20日，港中大1493位爱国爱港的内地研究生、182位教职员、57位留学生发表公开信《中大学生十问学校管理层》，严正指出，港中大已到了救亡图存的关键时刻，校内绝大多数的师生立场鲜明，坚决与暴力割席，可那些为官避事的管理层为何不觉得羞耻？
信中同时提出质疑：堂堂名校沦为“基地组织”，暴徒装扮与恐怖分子几无二致，校方竟对此视而不见，甚至默许其进入校园。更讽刺的是，本校师生进入校园反而要接受暴徒“安检”，其行径何其荒谬？！
