至于小智、小茂、武藏、小次郎和喵喵等角色，也成为了大众眼中耳熟能详的角色，甚至一个时代的流行文化符号。
动画的火爆也大大带动了游戏和其他形式的宝可梦产品，甚至动画的音乐在日本音乐著作权协会JASRAC国际奖上实现了空前绝后的“五连冠”。
商业上的巨大成功，也使得《宝可梦》主系列动画开始调整思路，朝着长期更新的思路发展，《宝可梦》动画经历了第一次“调整”，并在此之后走向一条相对“稳定”的发展道路。
首先，之前设置的完结和结局全部取消，动画朝着长期更新的方向发展。自此，《宝可梦》动画几乎失去“主线”这个概念，虽然依旧不失为一个优秀的商业动画作品，但是剧情逐步转向“日常”，并在超世代篇动画开始与游戏全面同步对接。
此后形成了一种新的模式——主角小智和皮卡丘会与游戏同步，不断前往下一地区，然后重新开启一段新的旅途、收集新的宝可梦。
其次，最初的电影-动画模式也在逐步“分离”。早期剧场版和动画完全“分享”世界观，如《超梦的逆袭》故事中，其实有很大一部分线索都是出现在TV动画中的。小茂挑战常青道馆时遇到的“不明宝可梦”（超梦），武藏、小次郎和喵喵向坂木汇报的时候遭遇的爆炸（超梦逃走），电影（剧场版）和动画紧密联系，成为一个完整的故事。
