莲雾在产地的主要病害有炭疽病、果腐病、藻斑病、疫病等。一般用50％多菌灵800倍液、70％甲基托布津800～1000倍液等进行防治。北方设施栽培在引进果苗时要严格把关，避免病菌带人。定植前可用药剂浸泡消毒。

产地的主要虫害有果实蝇、蓟马类、木虱、红蜘蛛等。北方设施栽培可以把好无虫苗这一关，栽培过程中把过密的枝条适当疏除，使树冠通风透光，减少虫害的发生。药剂可选用吡虫啉2000倍液、阿维菌素2000～3000倍液、哒螨灵3000倍液等药剂进行防治。