4个样品SNP在基因组中每条染色体上密度分布规律是一致的,其中在19号染色体上分布密度最大,12号染色体密度最小。
利用软件对SNP位点进行注释,进一步统计得到了SNP在基因组上的分布情况,在全基因组范围内,4个样品中均有71.00(±0.79)%的SNP发生在基因间区,1.48(±0.01)%发生在外显子,5.15(±0.16)%发生在内含子。

在编码区中,4个样品中有41.35(±0.06)%的SNP为同义突变位点,56.34(±0.09)%的SNP为非同义突变位点。
根据非同义突变在编码区占比来看,八字竹>厚竹>毛竹-江西万载>毛竹-湖南株洲,分别为56.48%、56.33%、56.32%和56.25%,该类型的突变可能会导致相关功能的改变甚至是形态上的变异。

位于编码区的移码突变同样会对基因的功能产生很大的影响,4个样品分别检测到SV的数量和类型,从数量上来看厚竹>八字竹>毛竹-江西万载>毛竹-湖南株洲。
4个样品中SV、SNP和InDel数量有所不同,但是总体来看都是厚竹>八字竹,通过SnpEff软件将样品与参考基因组位置信息进行比对。

注释SV发生位置,结果表明所有样品中约45.92(±0.51)%的SV发生在基因间区,5.30(±0.11)%发生在外显子区域,8.30(±0.11)%发生在内含子区。

