多种竹子的系统发育关系

为了明确这2种毛竹变异类型的亲缘关系，还利用重测序数据进行了系统发育研究，本研究中在2个毛竹变异类型以及2个野生毛竹个体样品中获得了2139383bpSNP位点。

将筛选到的SNP分别利用最大似然法和邻接法构建系统发育树，结果显示，八字竹和厚竹亲缘关系最近，在系统发育树中聚为姐妹群，且在该节点具有100%的支持率。

根据文献记载，八字竹是在引种栽培的厚竹林中发现的，因此，本研究结果支持八字竹是由厚竹变异而来的推断。

毛竹是我国最具有经济价值和生态价值的竹种之一，在长期的栽培和演化过程中形成了许多变异类型，如黄槽毛竹、绿槽毛竹、花竿毛竹和龟甲竹等。

本研究中的八字竹和厚竹属于毛竹变异类型中的竿型变异，厚竹竿壁厚度是等径毛竹的2倍，八字竹竹竿横切面呈“8”字形，竿壁厚度与野生毛竹没有明显差异，且形态学研究表明八字竹是由厚竹变异而来。

利用重测序技术将八字竹、厚竹和2个不同地区野生毛竹与毛竹参考基因组进行重测序比对，统计分析其SNP、InDel和SV变异情况。

根据基于SNP建立的系统发育树结果来看，八字竹和厚竹的亲缘关系较近，在系统发育树中以较高的支持率聚为姐妹群，结果支持了八字竹是由厚竹变异而来这一推断。