通过重测序分析对变异数据进行了统计分析,SNP变异的类型只涉及到单碱基的转换和颠换,本研究中的4个样品转换发生的数量是颠换数量的3.25(±0.01)倍。
但高于拟南芥研究中的比值,这表明在毛竹及其变异类型中,相同碱基类型间的相互突变的概率要比不同碱基类型间的突变概率高。

SNP杂合突变是纯和突变的4.05(±0.15)倍,与大豆、番茄、水稻中报告的比值相似,InDel指的是发生在基因组内的小片段(一般小于50bp)的缺失或插入突变。
发生在外显子区的非3整数倍的InDel会引起移码突变,造成编码蛋白质序列的改变,4个样品中发生缺失的类型是插入的1.57(±0.14)倍。

统计SNP和InDel在样品中每条染色体的分布情况发现,SNP在19号染色上密度最大,InDel在9号染色体密度最大。

实验的猜想和验证
SV指的是发生在基因组内的大片段(一般大于50bp)的缺失、插入、反转和易位等,也被称为结构变异,4个样品中5.30(±0.11)%SV发生在外显子区域,从变异数量来看,八字竹中SNP、InDel和SV的数量均比厚竹少。

